Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Csrnp3P59055 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms