Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usp25P57080 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp25P57080 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms