Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GferP56213 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GferP56213 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GferP56213 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GferP56213 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GferP56213 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GferP56213 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GferP56213 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GferP56213 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GferP56213 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GferP56213 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
GferP56213 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GferP56213 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
GferP56213 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
GferP56213 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GferP56213 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
GferP56213 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
GferP56213 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms