Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bp1P55194 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1P55194 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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