Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms