Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfx1P48377 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms