Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Rplp1P47955 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rplp1P47955 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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