Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Tnfsf9P41274 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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