Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpardP35396 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpardP35396 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpardP35396 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpardP35396 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpardP35396 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpardP35396 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpardP35396 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpardP35396 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms