Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Saa4P31532 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Saa4P31532 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Saa4P31532 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Saa4P31532 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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