Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxa2P31245 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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