Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gjb1P28230 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gjb1P28230 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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