Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pde6aP27664 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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