Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ifna9P09235 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms