Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P06330 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
P06330 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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