Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01801 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01801 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01801 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms