Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm10226O88253 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm10226O88253 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm10226O88253 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm10226O88253 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm10226O88253 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm10226O88253 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm10226O88253 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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