Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lnx1O70263 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lnx1O70263 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms