Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
DffaO54786 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
DffaO54786 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
DffaO54786 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms