Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Psmb10O35955 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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