Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnih1O35372 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cnih1O35372 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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