Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smad6O35182 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms