Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnk3O35111 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnk3O35111 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnk3O35111 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Kcnk3O35111 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Kcnk3O35111 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnk3O35111 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms