Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm2888K7N746 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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