Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 P2rx7-204ENSMUST00000121489 2576 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ang-202ENSMUST00000171688 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Gm21887J3QQ04 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Gm21887J3QQ04 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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