Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ddx60E9PZQ1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms