Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms