Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms