Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf217D3YYI7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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