Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Grik3B1AS29 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms