Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prr29B1ARI9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prr29B1ARI9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prr29B1ARI9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prr29B1ARI9 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Prr29B1ARI9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Prr29B1ARI9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Prr29B1ARI9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Prr29B1ARI9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Prr29B1ARI9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Prr29B1ARI9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr29B1ARI9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms