Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm6880A3KG45 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm6880A3KG45 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm6880A3KG45 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm6880A3KG45 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm6880A3KG45 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm6880A3KG45 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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