Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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