Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CtcflA2APF3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CtcflA2APF3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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