Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprfA2A8L5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprfA2A8L5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms