Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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