Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer3W4VSP1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer3W4VSP1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer3W4VSP1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms