Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vamp5Q9Z2P8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vamp5Q9Z2P8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vamp5Q9Z2P8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms