Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crlf3Q9Z2L7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crlf3Q9Z2L7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Crlf3Q9Z2L7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms