Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ap3b1Q9Z1T1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ap3b1Q9Z1T1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ap3b1Q9Z1T1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms