Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nek4Q9Z1J2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nek4Q9Z1J2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nek4Q9Z1J2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms