Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1G4

Atp6v0a1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0a1Q9Z1G4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v0a1Q9Z1G4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v0a1Q9Z1G4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp6v0a1Q9Z1G4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms