Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clip2Q9Z0H8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clip2Q9Z0H8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Clip2Q9Z0H8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clip2Q9Z0H8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms