Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Msl3Q9WVG9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msl3Q9WVG9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msl3Q9WVG9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msl3Q9WVG9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msl3Q9WVG9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms