Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tusc2Q9WVF8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tusc2Q9WVF8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tusc2Q9WVF8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms