Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnip1Q9WUU8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnip1Q9WUU8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnip1Q9WUU8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms