Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl5Q9WUP7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uchl5Q9WUP7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Uchl5Q9WUP7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Uchl5Q9WUP7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uchl5Q9WUP7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Uchl5Q9WUP7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Uchl5Q9WUP7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms