Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcd6ipQ9WU78 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcd6ipQ9WU78 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms