Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scnn1bQ9WU38 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scnn1bQ9WU38 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Scnn1bQ9WU38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scnn1bQ9WU38 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms