Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pfdn5Q9WU28 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pfdn5Q9WU28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pfdn5Q9WU28 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms